但是，过度依靠化学药杀虫防霉也引起了许多问题，如人畜累积毒、环境和粮食污染及害虫抗药性逐渐加强。有调查显示我国40个粮库所采集的米象、谷蠹、玉米象、锯谷盗、赤拟谷盗和锈赤扁谷盗等６个品系的77个虫样，其中抗性虫样约占62％，主要集中在河北、湖北、四川和广东等地。对于害虫抗性的形成，研究者提出了许多理论，如基学说、变学说等，但大都认为多次使用同种药剂会强化害虫对药剂的适应性。目前，因具有良好的扩散性、杀虫效果好、操作简单、成本低的优势，我国约90％的粮库采用磷氢熏蒸防治储粮害虫，其有的地位。
气调储藏技术为了解决化学药熏蒸所造成的问题，气调技术作为一种环保，安全，有效的储藏方式逐渐代替了等化学药熏蒸法，它有不使用化学药就可达到灭虫防霉，减缓粮食品质劣变和避免环境污染、害虫抗药性产生等优点。充氮气在对充氮气调储藏和常规储存的玉米品质进行了比较研究，结果显示，低温时，两种方式储藏的玉米品质无明显差异，在20℃储藏6个月，玉米发芽率由96％分别降低至87％、85％，脂肪酸值由22.4（KOH／干基）／（mg／100g）分别增长至45.9（KOH／干基）／（ｍｇ／100g）、47.4（KOH／干基）／（mg／100g）；在高温35℃储藏６个月，玉米的发芽率分别降低至42％、8％，脂肪酸值分别增长至49.5（KOH／干基）／（mg／100g）、57.6（KOH／干基）／（mg／100g），充氮气调储存的玉米品质指标变化程度都要比常规储藏小，气调储藏利于玉米储藏。
5生物防治技术生物源防虫剂是利用生物活或其产生的活性物质作为杀虫药剂，包含动物源、植物源、微生物源物质或其代谢产物。生物源防虫剂具有安全、无环境污染、效果好的优点，有一定的研究价值和发展潜力。植物源杀虫剂为了解决化学药剂储粮所带来的抗药性、环境污染等影响，研究者在探究和开发新型储粮保护剂的过程中发现，有些植物的次生代谢产物是为害虫而产生的化学活性物质，具有杀虫作用。目前，研究者对植物性储粮防治剂已经进行了大量研究，取得了许多成果。有研究表明，辣椒素对稻谷中的害虫有明显的驱避和触杀作用，可有效抑制稻谷表面微生物的生长。
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